社会学系的硕士研究生分为学术硕士和专业硕士两大类。其中学术硕士包括社会学(含女性学方向)、人类学、社会保障三个二级学科硕士点;专业硕士包括社会工作专业硕士(MSW)和社会政策专业硕士(MSP)。MSW共有四个方向，分别为社会服务机构管理、社区发展、高级临床社会工作、社会管理与社会政策;MSP为国内首批2家授权单位之一，已于2023年度招生季正式招生，也有四个方向，分别为“社会政策分析”、“人口、教育和健康”、“技术、劳动和环境”以及“社会领域和非传统安全”。

社会学系硕士研究生实施导师指导制度，获得录取资格的硕士研究生在入学后，将通过一个师生双向选择的机制，按照当年度的导师确定规则，从给定的导师名录内选取一名导师。社会学系将定期公布每一年度的导师确定规则和相应的各个专业和方向的导师名录。